MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Neisseria meningitidis Z2491 chromosome

Total Repeats: 47040

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003116	ATA	2	6	16	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003116	CTT	2	6	49	54	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218767052
3	NC_003116	CGC	2	6	79	84	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218767052
4	NC_003116	AGA	2	6	121	126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218767052
5	NC_003116	CGC	2	6	130	135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218767052
6	NC_003116	TTC	2	6	155	160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218767052
7	NC_003116	CCAT	2	8	192	199	25 %	25 %	0 %	50 %	218767052
8	NC_003116	CGT	2	6	220	225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218767052
9	NC_003116	GTCC	2	8	248	255	0 %	25 %	25 %	50 %	218767052
10	NC_003116	GGT	2	6	269	274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218767052
11	NC_003116	GTG	2	6	318	323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218767052
12	NC_003116	TG	3	6	345	350	0 %	50 %	50 %	0 %	218767052
13	NC_003116	T	6	6	374	379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003116	GAC	2	6	382	387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_003116	CGT	2	6	393	398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_003116	AGA	2	6	596	601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218767053
17	NC_003116	GTA	2	6	657	662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218767053
18	NC_003116	CAAA	2	8	671	678	75 %	0 %	0 %	25 %	218767053
19	NC_003116	CGGA	2	8	687	694	25 %	0 %	50 %	25 %	218767053
20	NC_003116	GCAG	2	8	712	719	25 %	0 %	50 %	25 %	218767053
21	NC_003116	CTT	2	6	830	835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218767053
22	NC_003116	GAA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218767053
23	NC_003116	GAT	2	6	930	935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218767053
24	NC_003116	GACG	2	8	936	943	25 %	0 %	50 %	25 %	218767053
25	NC_003116	GCAA	2	8	949	956	50 %	0 %	25 %	25 %	218767053
26	NC_003116	ACC	2	6	973	978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218767053
27	NC_003116	TTC	2	6	1023	1028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218767053
28	NC_003116	AACA	2	8	1122	1129	75 %	0 %	0 %	25 %	218767053
29	NC_003116	CGC	2	6	1185	1190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218767053
30	NC_003116	GAA	2	6	1224	1229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218767053
31	NC_003116	T	6	6	1290	1295	0 %	100 %	0 %	0 %	218767053
32	NC_003116	GTG	2	6	1326	1331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218767053
33	NC_003116	CGC	2	6	1353	1358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218767053
34	NC_003116	AAAG	2	8	1377	1384	75 %	0 %	25 %	0 %	218767053
35	NC_003116	TCA	2	6	1391	1396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218767053
36	NC_003116	ATG	2	6	1549	1554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218767053
37	NC_003116	ACAG	2	8	1555	1562	50 %	0 %	25 %	25 %	218767053
38	NC_003116	CTCAT	2	10	1573	1582	20 %	40 %	0 %	40 %	218767053
39	NC_003116	CGG	2	6	1616	1621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218767053
40	NC_003116	GCG	2	6	1633	1638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218767053
41	NC_003116	ACAA	2	8	1729	1736	75 %	0 %	0 %	25 %	218767053
42	NC_003116	TGG	2	6	1790	1795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218767053
43	NC_003116	GCC	2	6	1845	1850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218767053
44	NC_003116	GAA	2	6	2004	2009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218767053
45	NC_003116	GTT	2	6	2022	2027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218767053
46	NC_003116	GAA	2	6	2076	2081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218767053
47	NC_003116	CAT	3	9	2163	2171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218767053
48	NC_003116	AAG	2	6	2191	2196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218767053
49	NC_003116	CGG	2	6	2303	2308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218767053
50	NC_003116	GC	3	6	2339	2344	0 %	0 %	50 %	50 %	218767053
51	NC_003116	TTG	2	6	2359	2364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218767053
52	NC_003116	GAT	2	6	2409	2414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218767053
53	NC_003116	TTGA	2	8	2439	2446	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003116	GATT	2	8	2451	2458	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003116	TGTT	2	8	2469	2476	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003116	TAAA	2	8	2552	2559	75 %	25 %	0 %	0 %	218767054
57	NC_003116	CAC	2	6	2563	2568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218767054
58	NC_003116	CCA	2	6	2620	2625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218767054
59	NC_003116	TCT	2	6	2657	2662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218767054
60	NC_003116	TAA	2	6	2676	2681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218767054
61	NC_003116	CCG	2	6	2687	2692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218767054
62	NC_003116	ACC	2	6	2700	2705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218767054
63	NC_003116	CCT	2	6	2765	2770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218767054
64	NC_003116	CAT	2	6	2823	2828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218767054
65	NC_003116	TCT	2	6	2829	2834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_003116	ATT	2	6	2853	2858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003116	TTTCT	2	10	2870	2879	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_003116	GTC	2	6	2913	2918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_003116	GAC	2	6	2944	2949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_003116	TAA	2	6	2974	2979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218767055
71	NC_003116	GAT	2	6	3003	3008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218767055
72	NC_003116	TCG	2	6	3025	3030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218767055
73	NC_003116	T	6	6	3135	3140	0 %	100 %	0 %	0 %	218767055
74	NC_003116	TTC	2	6	3148	3153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218767055
75	NC_003116	CCAG	2	8	3164	3171	25 %	0 %	25 %	50 %	218767055
76	NC_003116	GAT	2	6	3237	3242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218767055
77	NC_003116	TTC	2	6	3243	3248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218767055
78	NC_003116	TGT	2	6	3335	3340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218767055
79	NC_003116	GCC	2	6	3372	3377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218767055
80	NC_003116	GGT	2	6	3411	3416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218767055
81	NC_003116	CGC	2	6	3440	3445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218767055
82	NC_003116	GGC	2	6	3455	3460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218767055
83	NC_003116	ACCT	2	8	3553	3560	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_003116	GCA	3	9	3652	3660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218767056
85	NC_003116	CTC	2	6	3875	3880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218767057
86	NC_003116	GTC	2	6	3893	3898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218767057
87	NC_003116	TTC	2	6	3911	3916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218767057
88	NC_003116	CCA	2	6	4054	4059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218767057
89	NC_003116	CAG	2	6	4067	4072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218767057
90	NC_003116	CCG	2	6	4078	4083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218767057
91	NC_003116	GCA	2	6	4096	4101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218767057
92	NC_003116	TTG	2	6	4140	4145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218767057
93	NC_003116	CGG	2	6	4150	4155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218767057
94	NC_003116	TCA	2	6	4165	4170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218767057
95	NC_003116	CAGAAT	2	12	4205	4216	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	218767057
96	NC_003116	CAA	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218767057
97	NC_003116	GCC	2	6	4264	4269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218767057
98	NC_003116	TTC	2	6	4286	4291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218767057
99	NC_003116	CAT	2	6	4307	4312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218767057
100	NC_003116	ACG	2	6	4314	4319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218767057
101	NC_003116	AAC	2	6	4326	4331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218767057
102	NC_003116	ACC	3	9	4353	4361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218767057
103	NC_003116	GCG	2	6	4440	4445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218767057
104	NC_003116	ATAAA	2	10	4508	4517	80 %	20 %	0 %	0 %	218767057
105	NC_003116	CTTT	2	8	4543	4550	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_003116	AAC	2	6	4661	4666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218767058
107	NC_003116	TGA	2	6	4739	4744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218767058
108	NC_003116	A	6	6	4846	4851	100 %	0 %	0 %	0 %	218767058
109	NC_003116	ACA	2	6	4875	4880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218767058
110	NC_003116	A	6	6	4893	4898	100 %	0 %	0 %	0 %	218767058
111	NC_003116	AAG	2	6	4941	4946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218767058
112	NC_003116	ATG	2	6	4959	4964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218767058
113	NC_003116	CAA	2	6	4972	4977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218767058
114	NC_003116	ACT	2	6	4981	4986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218767058
115	NC_003116	CAG	2	6	5040	5045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218767058
116	NC_003116	AAT	2	6	5088	5093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218767058
117	NC_003116	ATC	2	6	5107	5112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218767058
118	NC_003116	A	7	7	5144	5150	100 %	0 %	0 %	0 %	218767058
119	NC_003116	TTC	2	6	5212	5217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218767058
120	NC_003116	AAG	2	6	5292	5297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_003116	T	6	6	5407	5412	0 %	100 %	0 %	0 %	218767059
122	NC_003116	TCGG	2	8	5453	5460	0 %	25 %	50 %	25 %	218767059
123	NC_003116	CTT	2	6	5466	5471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218767059
124	NC_003116	AGA	2	6	5484	5489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218767059
125	NC_003116	GCG	2	6	5524	5529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218767059
126	NC_003116	TTC	2	6	5545	5550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218767059
127	NC_003116	CA	3	6	5589	5594	50 %	0 %	0 %	50 %	218767059
128	NC_003116	GCG	2	6	5670	5675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218767059
129	NC_003116	AAAT	2	8	5690	5697	75 %	25 %	0 %	0 %	218767059
130	NC_003116	A	6	6	5713	5718	100 %	0 %	0 %	0 %	218767059
131	NC_003116	GAC	2	6	5841	5846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_003116	CGT	2	6	5854	5859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_003116	ATC	2	6	5892	5897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218767060
134	NC_003116	ACA	2	6	6016	6021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218767060
135	NC_003116	CCG	2	6	6022	6027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218767060
136	NC_003116	CAAC	2	8	6095	6102	50 %	0 %	0 %	50 %	218767060
137	NC_003116	GAA	2	6	6164	6169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218767060
138	NC_003116	TGCGAA	2	12	6173	6184	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	218767060
139	NC_003116	GTG	2	6	6200	6205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218767060
140	NC_003116	GC	3	6	6247	6252	0 %	0 %	50 %	50 %	218767060
141	NC_003116	GGTT	2	8	6253	6260	0 %	50 %	50 %	0 %	218767060
142	NC_003116	CGG	2	6	6268	6273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218767060
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146	NC_003116	AGCCC	2	10	6494	6503	20 %	0 %	20 %	60 %	218767060
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152	NC_003116	TTTG	2	8	6662	6669	0 %	75 %	25 %	0 %	218767060
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